Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VAPAQ9P0L0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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VAPAQ9P0L0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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