Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms