Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms