Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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