Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms