Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms