Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms