Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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