Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms