Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms