Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNPPD1Q9BV87 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms