Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED18Q9BUE0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms