Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms