Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms