Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC8Q8TC99 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms