Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL3Q8TAT5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms