Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms