Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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