Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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