Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms