Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms