Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms