Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN4Q56A73 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms