Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms