Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDLIM3Q53GG5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PDLIM3Q53GG5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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