Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms