Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4L6Q3SYB3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms