Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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