Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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