Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms