Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCBQ16585 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCBQ16585 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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