Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SSX1Q16384 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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