Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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