Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JMJD1CQ15652 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms