Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms