Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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