Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB35Q15286 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB35Q15286 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB35Q15286 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB35Q15286 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB35Q15286 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB35Q15286 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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