Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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