Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms