Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR4Q13639 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms