Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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