Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TCIRG1Q13488 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TCIRG1Q13488 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TCIRG1Q13488 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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