Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms