Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms