Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPA4Q13156 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPA4Q13156 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPA4Q13156 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPA4Q13156 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPA4Q13156 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms