Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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