Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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