Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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