Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms