Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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